中水回用水主要有下列水质指标。
(1)物理指标 主要包括浊度(悬浮物)、色度、味、电导率、含油量、溶解性固体、温度等。
(2)化学指标 主要包括pH值、硬度、金属与重金属离子(铁、铬、铜、锌、镉、镍、锑、汞)、挥发性酚、氯化物、硫化物、氰化物、阴阳离子合成洗涤剂等。
(3)生物化学指标 主要包括：
①生化需氧量(BOD5)，即在规定条件下，水中有机物和无机物在生物氧化作用下所消耗的溶解氧量(以质量浓度表示);
②化学需氧量(CODCr)，指在一定条件下，经重铬酸钾氧化处理时，水中的溶解性物质和悬浮物所消耗的与消耗的与重铬酸盐相对应得氧的质量浓度;
③总有机碳(TOC)与总需氧量(TOD)，都是通过仪器用燃烧法快速测定的水中有机碳与可氧化物质的含量，并可同BOD、CODCr建立对应的定量关系。
(4)毒理学指标 有些化学物质在水中的含量达到一定的限度就会对人体或其他生物造成危害，称为水的毒理学指标。毒理学指标包括氟化物、有毒重金属离子、汞、砷、硒、酚类和各类致癌、致畸、致基因突变的有机污染物质(如多氯联苯、多环芳烃、芳香胺类和以总三卤甲烷为代表的有机卤化物等)，以及亚硝酸盐、一部分农药、放射性物质。毒理学指标实际上是指化学指标中有毒性的化学物质。
(5)细菌学指标 细菌学指标是反映威胁人类健康的病原体污染指标，如大肠杆菌数、细菌总数、寄生虫卵、余氯等。余氯是反映水的消毒效果和防止二次污染的贮备能力。
(6)其他指标 包括那些在工农业生产中或其他用水过程对回用水质有一定要求的水质指标。